Stellenbeschreibung
Am Institut für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin des Universitätsklinikums Dresden ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine Stelle als Bioinformatiker / Bioinformatikerin / Computational Biologist (m/w/d) mit dem Schwerpunkt Analyse komplexer Omics-Datensätze und Multi-Omics-Integration und Analyse und Integration von Omics-Datensätzen in der translationalen Forschung in Voll- oder Teilzeitbeschäftigung zunächst befristet für 24 Monate zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TV-L) und ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die Entgeltgruppe 13 möglich.
Ihre Aufgaben
- Analyse, Integration und Interpretation von hochdimensionalen Omics-Datensätzen im Kontext translationaler Forschungs- und Diagnostikprojekte
- Bioinformatische Auswertung von bulk RNA-Sequenzierung, Single-Cell- und Single-Nucleus RNA-Seq, CITE-Seq, ATAC-Seq, NGS-basierten Datensätzen, Metabolomics- und Proteomics-Daten
- Entwicklung, Erweiterung und Wartung von Analysepipelines für Omics-Daten (inkl. Qualitätskontrolle, Normalisierung, Annotation und statistischer Auswertung)
- Multi-Omics-Integration (z.B. Transkriptomik-Epigenomik-Metabolomik-Proteomik) zur Ableitung biologisch und klinisch relevanter Hypothesen
- Enge Zusammenarbeit mit experimentellen Wissenschaftler:innen, Kliniker:innen und Diagnostiker:innen
- Unterstützung bei der methodischen Implementierung bioinformatischer Workflows in translationalen und ggf. kliniknahen Kontexten
- Mitwirkung bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen, Drittmittelanträgen und Präsentationen
Ihr Profil
- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium mit Promotion (z.B. Bioinformatik, Computational Biology, Systembiologie, Biostatistik, Molekulare Medizin oder verwandte Fachrichtungen)
- Ausgewiesene praktische Erfahrung in der Analyse von Omics-Datensätzen, insbesondere: bulk und single-cell RNA-Seq, CITE-Seq und/oder ATAC-Seq, idealerweise Metabolomics und/oder Proteomics
- Sehr gute Programmierkenntnisse in R, Erfahrung mit relevanten Bioconductor-Frameworks (z.B. Seurat, SingleCellExperiment, edgeR, DESeq2)
- Gute bis sehr gute Kenntnisse in Python (z.B. Scanpy, Pandas, NumPy, SciPy)
- Erfahrung im Aufbau, der Anpassung und Dokumentation von reproduzierbaren Analysepipelines (z.B. mit Snakemake, Nextflow, Git)
- Verständnis für statistische Methoden, Datenintegration und Visualisierung komplexer Datensätze
- Strukturierte, eigenständige Arbeitsweise sowie ausgeprägte Team- und Kommunikationsfähigkeit
- Interesse an translationaler Forschung und der Anwendung bioinformatischer Methoden im medizinischen Kontext
Wir bieten
- Mitarbeit an wissenschaftlich und klinisch hochrelevanten Projekten im Bereich chronisch-inflammatorischer Erkrankungen und Krebsforschung
- Ein interdisziplinäres Umfeld mit enger Anbindung an klinische Partner
- Moderne IT- und Analyseinfrastruktur
- Möglichkeit zur wissenschaftlichen Weiterqualifikation (inkl. Habilitation)
- Attraktive Angebote zur Gesundheitsförderung (Carus Vital)
- Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten über die Carus Akademie
- Betriebliche Altersvorsorge
- Nutzung des Jobtickets für den öffentlichen Nahverkehr in Dresden und Umgebung