Über das Unternehmen
Das Universitätsklinikum Köln ist eines der führenden Universitätskliniken in Deutschland und verbindet Forschung, Lehre und Krankenversorgung auf Spitzenniveau. Das Zentrum für Familiäre Brust- und Eierstockkrebs ist ein führendes Kompetenzzentrum für Diagnostik, Beratung und Forschung zu erblichen Tumorerkrankungen und wird derzeit zum Institut für familiäre Tumorerkrankungen ausgebaut.
Aufgaben
- Analyse und Interpretation von NGS-Daten (Panel, WGS: Short- und Long-Reads) in Forschungs- und Diagnostikprojekten
- Entwicklung, Automatisierung und Optimierung bioinformatischer Analysepipelines zur Auswertung klinischer Sequenzdaten
- Weiterentwicklung und Betrieb bestehender diagnostischer Softwarelösungen
- Entwicklung bioinformatischer Schnittstellen und Webservices für diagnostische Anwendungen
- Mitarbeit an wissenschaftlichen Publikationen und Präsentation von Ergebnissen
Anforderungen
- Abgeschlossenes Studium der Bioinformatik, Medizininformatik, Informatik oder vergleichbarer Fachrichtung (Master/Diplom)
- Erfahrung in der NGS-Datenanalyse, idealerweise mit humangenetischem Schwerpunkt
- Sicherer Umgang mit mindestens einer Programmiersprache (z.B. Python, R, Java)
- Programmiererfahrung mit einem Workflow-System, vorzugsweise Nextflow oder Snakemake
- Vertrautheit mit Linux-Umgebungen und HPC-Systemen
- Gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Benefits
- Sicherer und sinnstiftender Job in anspruchsvollem Arbeitsumfeld
- Flexible Arbeitszeitkonten und Wunschdienstpläne
- Interdisziplinäres Team mit gegenseitiger Wertschätzung
- Breite Entwicklungsmöglichkeiten als einer der größten Arbeitgeber der Region
- Unterstützung zur Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben
- Teilzeitoptionen möglich