Stellenangebot: Bioinformatiker (m/w/d)
Als Teil des Universitätsklinikums sind Sie in einem Modellvorhaben zur Genomsequenzierung tätig und fungieren als Schnittstelle zwischen Pathologie und Medizininformatik. Sie analysieren selbstständig Sequenzierungsdaten, passen bioinformatische Pipelines an und bereiten die Ergebnisse für die Befunderstellung auf. Darüber hinaus wirken Sie an Qualitätssicherungsmaßnahmen mit.
Ihre Aufgaben
- Mitarbeit im Modellvorhaben Genomsequenzierung in enger Zusammenarbeit mit klinischen und wissenschaftlichen Partnern
- Schnittstellenfunktion zwischen Pathologie und Medizininformatik, Teilnahme an Tumorboards
- Eigenständige Analyse von Sequenzierungsdaten, insbesondere Genpanel, WES und WGS
- Anpassung und Anwendung bioinformatischer Analysepipelines, Unterstützung bei der Etablierung und Weiterentwicklung von Workflows für die genomische Diagnostik
- Interpretation und Aufbereitung der Analyseergebnisse für die weitere Befunderstellung
- Dokumentation der Analysen sowie Mitwirkung an Qualitätssicherungsmaßnahmen
Ihr Profil
- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in (Medizin-/Bio-) Informatik oder einem verwandten Fachgebiet
- Fundierte Kenntnisse in der Analyse von NGS-Daten (RNA-Seq, WES, WGS, etc.)
- Erfahrung im Umgang mit gängigen bioinformatischen Tools und Pipelines (z.B. sarek, strelka, cnvkit, DRAGEN) und Datenformaten (z.B. FASTQ, BAM, VCF)
- Sehr gute Programmierkenntnisse (z.B. Python, R) sowie Erfahrung mit Linux-Umgebungen
- Erfahrung mit Datenbanktechnologien sowie gängigen Datenintegrationswerkzeugen
- Ausgeprägte Fähigkeit zum selbstständigen, strukturierten und lösungsorientierten Arbeiten, Kommunikations- und Teamfähigkeit sowie Bereitschaft zur interdisziplinären Zusammenarbeit
- Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Wir bieten Ihnen
- Attraktive Vergütung bis zur Entgeltgruppe 13 unseres Haustarifvertrages
- Vermögenswirksame Leistungen und betriebliche Altersvorsorge (VBL)
- 30 Tage Erholungsurlaub
- Digitales Informationsportal und flexible Einarbeitungsphase für einen gelungenen Einstieg
- Individuelle Entwicklungsmöglichkeiten